Estructura composicional y diversidad de la comunidad fúngica asociada a semillas de híbridos comerciales de sorgo

Autores
Velazquez, Pablo Daniel
Año de publicación
2026
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Las semillas de cultivos extensivos albergan comunidades microbianas complejas cuya composición puede influir en la sanidad y el establecimiento del cultivo. Sin embargo, los estudios en patología de semillas se han centrado tradicionalmente en la detección de patógenos individuales, con escasa incorporación de enfoques de ecología de comunidades. El objetivo de este trabajo fue analizar la estructura composicional y la diversidad de la comunidad fúngica asociada a semillas de híbridos comerciales de sorgo. Se evaluaron semillas de treinta híbridos mediante la técnica de papel húmedo (blotter test) y se registró la incidencia (%) de los géneros fúngicos. A partir de una matriz híbrido × género se aplicaron métricas de diversidad (riqueza, Shannon y Simpson), correlaciones de Spearman, curvas de rango–abundancia y herramientas multivariadas (mapa de calor, agrupamiento jerárquico y análisis de componentes principales). Se detectaron 16 géneros fúngicos, con predominio de Alternaria, Fusarium y Cladosporium. La comunidad mostró un gradiente consistente de diversidad–dominancia, con fuerte correlación negativa entre los índices de Shannon y Simpson (ρ = −0,96; p < 0,001). Los análisis multivariados evidenciaron patrones composicionales definidos y la existencia de grupos de híbridos con perfiles diferenciados. En conjunto, las semillas albergaron comunidades fúngicas estructuradas, caracterizadas por la dominancia de pocos géneros y la presencia de numerosos taxones de baja incidencia. La integración de métricas de diversidad y herramientas multivariadas permitió reinterpretar datos de sanidad de semillas desde un enfoque de ecología de comunidades, ampliando la comprensión de la estructura microbiológica del material de siembra.
Seeds of agricultural crops harbor complex microbial communities whose composition may influence seed health and crop establishment. However, seed pathology studies have traditionally focused on the detection of individual pathogens, with limited incorporation of community ecology approaches. The objective of this study was to analyze the compositional structure and diversity of the fungal community associated with seeds of commercial sorghum hybrids. Seeds from thirty hybrids were evaluated using the blotter test, and the incidence (%) of fungal genera was recorded. Based on a hybrid × genus matrix, diversity metrics (richness, Shannon, and Simpson), Spearman correlations, rank–abundance curves, and multivariate tools (heatmap, hierarchical clustering, and principal component analysis) were applied. Sixteen fungal genera were detected, with predominance of Alternaria, Fusarium, and Cladosporium. The community exhibited a consistent diversity–dominance gradient, with a strong negative correlation between the Shannon and Simpson indices (ρ = −0.96; p < 0.001). Multivariate analyses revealed defined compositional patterns and the existence of groups of hybrids with differentiated profiles. Overall, the seeds harbored structured fungal communities characterized by the dominance of a few genera and the presence of numerous low-incidence taxa. The integration of diversity metrics and multivariate tools allowed the reinterpretation of seed health data from a community ecology perspective, expanding the understanding of the microbiological structure of planting material.
EEA Paraná
Fil: Velazquez, Pablo Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Paraná; Argentina
Fuente
FAVE. Sección Ciencias Agrarias 25 : e0059. (agosto 2026)
Materia
Sorgo
Variedades
Biodiversidad
Microbiomas
Salud de las Semillas
Híbridos
Sorghum
Varieties
Sorghum bicolor
Biodiversity
Microbiomes
Seed Health
Hybrids
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Se evaluaron semillas de treinta híbridos mediante la técnica de papel húmedo (blotter test) y se registró la incidencia (%) de los géneros fúngicos. A partir de una matriz híbrido × género se aplicaron métricas de diversidad (riqueza, Shannon y Simpson), correlaciones de Spearman, curvas de rango–abundancia y herramientas multivariadas (mapa de calor, agrupamiento jerárquico y análisis de componentes principales). Se detectaron 16 géneros fúngicos, con predominio de Alternaria, Fusarium y Cladosporium. La comunidad mostró un gradiente consistente de diversidad–dominancia, con fuerte correlación negativa entre los índices de Shannon y Simpson (ρ = −0,96; p < 0,001). Los análisis multivariados evidenciaron patrones composicionales definidos y la existencia de grupos de híbridos con perfiles diferenciados. En conjunto, las semillas albergaron comunidades fúngicas estructuradas, caracterizadas por la dominancia de pocos géneros y la presencia de numerosos taxones de baja incidencia. La integración de métricas de diversidad y herramientas multivariadas permitió reinterpretar datos de sanidad de semillas desde un enfoque de ecología de comunidades, ampliando la comprensión de la estructura microbiológica del material de siembra.Seeds of agricultural crops harbor complex microbial communities whose composition may influence seed health and crop establishment. However, seed pathology studies have traditionally focused on the detection of individual pathogens, with limited incorporation of community ecology approaches. The objective of this study was to analyze the compositional structure and diversity of the fungal community associated with seeds of commercial sorghum hybrids. Seeds from thirty hybrids were evaluated using the blotter test, and the incidence (%) of fungal genera was recorded. Based on a hybrid × genus matrix, diversity metrics (richness, Shannon, and Simpson), Spearman correlations, rank–abundance curves, and multivariate tools (heatmap, hierarchical clustering, and principal component analysis) were applied. Sixteen fungal genera were detected, with predominance of Alternaria, Fusarium, and Cladosporium. The community exhibited a consistent diversity–dominance gradient, with a strong negative correlation between the Shannon and Simpson indices (ρ = −0.96; p < 0.001). Multivariate analyses revealed defined compositional patterns and the existence of groups of hybrids with differentiated profiles. Overall, the seeds harbored structured fungal communities characterized by the dominance of a few genera and the presence of numerous low-incidence taxa. The integration of diversity metrics and multivariate tools allowed the reinterpretation of seed health data from a community ecology perspective, expanding the understanding of the microbiological structure of planting material.EEA ParanáFil: Velazquez, Pablo Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Paraná; ArgentinaFacultad de Ciencias Agrarias, Universidad Nacional del Litoral2026-08-26T12:01:43Z2026-08-26T12:01:43Z2026-08info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/27550https://bibliotecavirtual.unl.edu.ar/publicaciones/index.php/FAVEAgrarias/es/article/view/154472346-91291666-7719FAVE. Sección Ciencias Agrarias 25 : e0059. 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Seeds of agricultural crops harbor complex microbial communities whose composition may influence seed health and crop establishment. However, seed pathology studies have traditionally focused on the detection of individual pathogens, with limited incorporation of community ecology approaches. The objective of this study was to analyze the compositional structure and diversity of the fungal community associated with seeds of commercial sorghum hybrids. Seeds from thirty hybrids were evaluated using the blotter test, and the incidence (%) of fungal genera was recorded. Based on a hybrid × genus matrix, diversity metrics (richness, Shannon, and Simpson), Spearman correlations, rank–abundance curves, and multivariate tools (heatmap, hierarchical clustering, and principal component analysis) were applied. Sixteen fungal genera were detected, with predominance of Alternaria, Fusarium, and Cladosporium. The community exhibited a consistent diversity–dominance gradient, with a strong negative correlation between the Shannon and Simpson indices (ρ = −0.96; p < 0.001). Multivariate analyses revealed defined compositional patterns and the existence of groups of hybrids with differentiated profiles. Overall, the seeds harbored structured fungal communities characterized by the dominance of a few genera and the presence of numerous low-incidence taxa. The integration of diversity metrics and multivariate tools allowed the reinterpretation of seed health data from a community ecology perspective, expanding the understanding of the microbiological structure of planting material.
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Fil: Velazquez, Pablo Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Paraná; Argentina
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