Caracterización y dinámica evolutiva de secuencias repetidas en especies de la sección Arachis (género Arachis, Leguminosae)

Autores
Samoluk, Sergio Sebastián; Vaio, Magdalena; Chalup, Laura María Isabel; Robledo, Gerardo Lucio; Seijo, José Guillermo
Año de publicación
2021
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Fil: Samoluk, Sergio Sebastián. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Samoluk, Sergio Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
Fil: Vaio, Magdalena. Universidad de la República. Facultad de Agronomía; Uruguay.
Fil: Chalup, Laura María Isabel. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Chalup, Laura María Isabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
Fil: Robledo, Gerardo Lucio. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Robledo, Gerardo Lucio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
Fil: Seijo, José Guillermo. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
Las especies de Arachis se caracterizan por una elevada diversidad genómica y cariotípica, principalmente determinada por cambios cualitativos y cuantitativos en la eu- y heterocromatina. Sin embargo, poco se conoce acerca de los cambios globales en la fracción repetitiva que condujeron a dicha diversidad en este género. En este trabajo, se realizó un análisis comparativo de la fracción repetitiva de ADN en especies diploides, con 2n=20, pertenecientes a diferentes genomas de la sección Arachis a partir de datos de secuenciación genómica de baja cobertura. En todas las especies analizadas, la fracción repetitiva de ADN constituye aproximadamente el 70% del genoma. Las especies pertenecientes a un mismo genoma presentaron una composición similar de secuencias repetidas mientras que las diferencias fueron más significativas en comparaciones intergenómicas. Las variaciones más notables se encontraron en dos grupos de elementos repetitivos, uno perteneciente a las secuencias móviles y el otro a las secuencias satélites. Los retrotransposones Athila (LTR/Ty3-gypsy) fueron los más abundantes, mostrando diferencias significativas tanto en abundancia como en los perfiles transposicionales temporales. Por otro lado, una superfamilia de ADN satélite rica en AT presentó una amplia variación en abundancia intergenómica explicando gran parte de las diferencias en los patrones de heterocromatina. Los resultados sugieren que la acumulación y distribución diferencial de retrotransposones Athila y de una superfamilia de ADN satélite rico en AT fueron los principales fenómenos que acompañaron la evolución de los diferentes genomas diploides de la sección Arachis.
Materia
Género Arachis
Especies Diploides
Secuencias repetidas
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
Repositorio Institucional de la Universidad Nacional del Nordeste (UNNE)
Institución
Universidad Nacional del Nordeste
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Las especies de Arachis se caracterizan por una elevada diversidad genómica y cariotípica, principalmente determinada por cambios cualitativos y cuantitativos en la eu- y heterocromatina. Sin embargo, poco se conoce acerca de los cambios globales en la fracción repetitiva que condujeron a dicha diversidad en este género. En este trabajo, se realizó un análisis comparativo de la fracción repetitiva de ADN en especies diploides, con 2n=20, pertenecientes a diferentes genomas de la sección Arachis a partir de datos de secuenciación genómica de baja cobertura. En todas las especies analizadas, la fracción repetitiva de ADN constituye aproximadamente el 70% del genoma. Las especies pertenecientes a un mismo genoma presentaron una composición similar de secuencias repetidas mientras que las diferencias fueron más significativas en comparaciones intergenómicas. Las variaciones más notables se encontraron en dos grupos de elementos repetitivos, uno perteneciente a las secuencias móviles y el otro a las secuencias satélites. Los retrotransposones Athila (LTR/Ty3-gypsy) fueron los más abundantes, mostrando diferencias significativas tanto en abundancia como en los perfiles transposicionales temporales. Por otro lado, una superfamilia de ADN satélite rica en AT presentó una amplia variación en abundancia intergenómica explicando gran parte de las diferencias en los patrones de heterocromatina. Los resultados sugieren que la acumulación y distribución diferencial de retrotransposones Athila y de una superfamilia de ADN satélite rico en AT fueron los principales fenómenos que acompañaron la evolución de los diferentes genomas diploides de la sección Arachis.
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