Identificación y caracterización de la familia de genes DOF en el genoma de Arachis hypogaea L

Autores
Samoluk, Sergio Sebastián; Seijo, José Guillermo
Año de publicación
2022
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Fil: Samoluk, Sergio Sebastián. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Samoluk, Sergio Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
Fil: Seijo, José Guillermo. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
La familia de genes Dof codifica para un grupo de factores de transcripción específicos de plantas. Los estudios de estos genes en algunos cultivos agronómicamente importantes han revelado que los mismos tienen un papel crucial en muchos procesos de desarrollo y de respuesta a diversos tipos de estrés. La reciente publicación de los genomas del maní y sus progenitores silvestres ha generado una gran oportunidad para realizar aproximaciones genómicas que pueden ayudar a comprender la regulación de muchos caracteres de interés para el mejoramiento del cultivo. El objetivo de este trabajo fue realizar una caracterización detallada de la estructura, organización, evolución y expresión de la familia de genes Dof en Arachis hypogaea (cultivar Tifrunner), mediante análisis bioinformáticos exhaustivos. Se detectaron un total de 61 genes distribuidos en las 20 seudomoléculas del genoma. Diferentes eventos de duplicación segmentaria y en tándem contribuyeron a la expansión de esta familia génica. Aunque las proteínas encontradas fueron variables en longitud, peso molecular y punto isoeléctrico, todas presentaron un dominio altamente conservado de 52 residuos aminoacídicos correspondiente a una estructura de dedo de zinc, característico de estos factores de transcripción. El análisis filogenético reveló la existencia de diferentes grupos de secuencias con patrones particulares en la distribución de dominios proteicos, así como de las estructuras exónicas e intrónicas. En la región promotora se encontraron motivos reguladores asociados a procesos fisiológicos tales como la respuesta a hormonas, a la luz y al estrés. Los niveles de expresión de estos genes fueron variables en los diferentes tejidos y etapas de desarrollo de la planta. Los resultados obtenidos constituyen la base para los estudios funcionales adicionales de los genes Dof en el maní cultivado.
Materia
Genes dof
Arachis Hypogaea
Análisis bioinformáticos
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
Repositorio Institucional de la Universidad Nacional del Nordeste (UNNE)
Institución
Universidad Nacional del Nordeste
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La familia de genes Dof codifica para un grupo de factores de transcripción específicos de plantas. Los estudios de estos genes en algunos cultivos agronómicamente importantes han revelado que los mismos tienen un papel crucial en muchos procesos de desarrollo y de respuesta a diversos tipos de estrés. La reciente publicación de los genomas del maní y sus progenitores silvestres ha generado una gran oportunidad para realizar aproximaciones genómicas que pueden ayudar a comprender la regulación de muchos caracteres de interés para el mejoramiento del cultivo. El objetivo de este trabajo fue realizar una caracterización detallada de la estructura, organización, evolución y expresión de la familia de genes Dof en Arachis hypogaea (cultivar Tifrunner), mediante análisis bioinformáticos exhaustivos. Se detectaron un total de 61 genes distribuidos en las 20 seudomoléculas del genoma. Diferentes eventos de duplicación segmentaria y en tándem contribuyeron a la expansión de esta familia génica. Aunque las proteínas encontradas fueron variables en longitud, peso molecular y punto isoeléctrico, todas presentaron un dominio altamente conservado de 52 residuos aminoacídicos correspondiente a una estructura de dedo de zinc, característico de estos factores de transcripción. El análisis filogenético reveló la existencia de diferentes grupos de secuencias con patrones particulares en la distribución de dominios proteicos, así como de las estructuras exónicas e intrónicas. En la región promotora se encontraron motivos reguladores asociados a procesos fisiológicos tales como la respuesta a hormonas, a la luz y al estrés. Los niveles de expresión de estos genes fueron variables en los diferentes tejidos y etapas de desarrollo de la planta. Los resultados obtenidos constituyen la base para los estudios funcionales adicionales de los genes Dof en el maní cultivado.
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