Análisis genómico comparativo de la familia de genes SRS en Arachis hypogaea (Leguminosae)

Autores: Gutiérrez, Tiago; Pérez, Gimena Abril; Leguizamón, Joel; Chalup, Laura María Isabel; Seijo, José Guillermo; Samoluk, Sergio Sebastián
Año de publicación: 2023
Idioma: español castellano
Tipo de recurso: documento de conferencia
Estado: versión publicada
Descripción: Fil: Gutiérrez, Tiago. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Gutiérrez, Tiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
Fil: Pérez, Gimena Abril. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Pérez, Gimena Abril. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
Fil: Leguizamón, Joel. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Leguizamón, Joel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
Fil: Chalup, Laura María Isabel. Universidad Nacional del Chaco Austral; Argentina.
Fil: Seijo, José Guillermo. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
Fil: Samoluk, Sergio Sebastián. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Exactas, Naturales y Agrimensura; Argentina.
Fil: Samoluk, Sergio Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina.
La familia génica SRS codifica para un grupo de factores transcripción de plantas, que regulan procesos fisiológicos relacionados con el crecimiento, desarrollo y respuesta a estrés. El maní es uno de los cultivos de leguminosas más importantes del mundo y nuestro país es uno de sus principales productores. En este trabajo se realizó la caracterización global de la familia SRS en el genoma del cv. Tifrunner (PeanutBase), incluyendo inferencias filogenéticas, estructuras génicas, duplicaciones y diversidad de expresión. En total, se identificaron 28 genes de longitud y estructura variable. El análisis con Protparam-Expasy reveló diferente peso molecular y punto isoeléctrico en las proteínas. Las búsquedas con HMMER revelaron la presencia de dominios IXGH y ring-like zinc finger, característicos de esta familia. Análisis comparativos de la región promotora contra la base de datos PlantCare reveló motivos relacionados con el crecimiento, desarrollo y respuestas a diferentes tipos de estrés. Los análisis filogenéticos obtenidos por RAxML-NG evidenciaron seis grupos con estructuras génicas y proteicas particulares. Resultados de BLASTp sugieren que eventos de duplicación segmentaria habrían participado en la diversificación de esta familia. Análisis de RNAseq sugieren patrones particulares de expresión en diferentes tejidos y estados del desarrollo. La caracterización estructural de estos genes constituye la base para el desarrollo de análisis funcionales de mecanismos asociados a caracteres de interés agronómico.
Materia: Familia Génica Srs
Maní
Arachis Hypogaea
Nivel de accesibilidad: acceso abierto
Condiciones de uso: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
Institución: Universidad Nacional del Nordeste
OAI Identificador: oai:repositorio.unne.edu.ar:123456789/60543

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